Pakiet Aivia Neuro jest przeznaczony dla grup badawczych poszukujących zautomatyzowanego rozwiązania do śledzenia neuronów. Pakiet Aivia zawiera ultraszybki protokół analizy neuronów, która generuje pełną rekonstrukcję obrazu neuronu w kilka sekund. Możesz rozszerzyć swoją analizę dzięki opcjonalnemu wykrywaniu kręgosłupa według odpowiedniego protokołu. Ponadto Aivia Neuro zapewnia także intuicyjne, wspomagane komputerowo narzędzia do śledzenia neuronów, które pomoże Ci edytować wyniki automatycznej analizy lub stworzyć własną rekonstrukcję.
Podstawa wszystkich pakietów Aivia. Wyposażony jest w wysokowydajne maszynymdo renderowania objętości i powierzchni, które są w stanie obsłużyć nawet najbardziej wymagające zestawy danych mikroskopowych (wiele terabajtów; wiele kanałów). Oferuje szeroką gamę modeli wizualizacji, które umożliwiają eksplorację danych. Podstawowe opcje ilościowe, takie jak pomiar, arkusz kalkulacyjny, wykresy i adnotacje są również zawarte w Aivia Base.
Możesz wyszkolić model Machine Learning, aby odróżniał obiekty będące przedmiotem zainteresowania od tła. Pixel Classifier zapewnia skuteczny sposób wykrywania obiektów na obrazach, w których konwencjonalne metody oparte na progach nie są wystarczające
Protokół 3D Neuron Analysis w Aivia wykrywa i automatycznie śledzi dendryty na fluorescencyjnych obrazach wolumetrycznych 3D. Protokół ten zawiera opcje śledzenia dendrytów z somą lub bez niej, a także opcje automatycznego wykrywania kolców dendrytycznych. Po zastosowaniu protokołu możesz rozszerzyć analizę, stosując wstępnie wyszkolony klasyfikator neuronów, aby sklasyfikować wykryte neurony.
Neuron Composer umożliwia edycję wyników analizy wykrytych neuronów lub ręczne śledzenie neuronów na obrazie 3D. Możesz śledzić dendryty za pomocą narzędzia Predict Segment i dodawać kolce do wyników analizy jednym kliknięciem za pomocą narzędzia Spine Editor. Możesz także edytować sieć dendrytyczną, usuwając nieprawidłowe połączenia sieciowe na obrazie i ponownie łącząc się z odpowiednim segmentem.
